持续在世界各地进行修业之旅的小智（松本梨香 配音）、小刚（うえだゆうじ 配音）和小光（豊口めぐみ 配音），历经长途跋涉终于来到了位于山谷丘陵处的目的地阿拉莫斯镇。小镇上耸立着象征时间与空间的时光之塔，新一轮的神奇宝贝竞赛将在塔的下方举行。小智一行走错了路，却由此结识当地的美丽女孩艾丽丝（加藤ローサ 配音）。紧张的战斗与快乐的游玩，却未察觉危险正悄悄逼进。小智遭到噩梦精灵达库莱伊的袭击，虽然达库莱伊被当地所有人讨厌，但是它似乎想将某种危险、恐怖的信息及时传给小智一行，关于时空之塔的秘密即将揭开…… 本片为神奇宝贝系列第十部电影剧场版。

闪电十一人 剧场版 最强军团奥加袭来是系列作中的第一个剧场版动画并且同时上映2D电影和3D电影。可以和NDS游戏‘闪电十一人3 挑战世界!! 王牙版’连动、就连游戏中的原创角色也会登场。另外81 Produce一般公开新人声优选秀会而获得小学馆奖的加藤梓等4名也客串演出。作为入场者限定特典是放有公仔的圆堂御守来作为全国前一百万名观众的礼物。宣传词为“这次的敌人从未来来了!我们一定要守护现在!!”。

系列作中的第二个剧场版动画并且同时上映2D电影和3D电影，较特别的是与第一作电影一样在12月23日上映。可以和Wii游戏‘闪电十一人 王牌前锋’连动。此外，一些于动画版中暂未登场之前代角色也会于本作登场。故事中主角松风天马及雷门足球社的伙伴们， 参加了“神圣之道”的竞赛，在进行决定中学足球第一名赛事的同时， 暗中也进行着决定下一届圣帝的大会，但无视于胜败命令的雷门足球社， 用尽全力的在进行比赛。而在本次的电影作品中， 雷门足球社收到了必需参加强化合宿的命令……